Mega Man revient pointer son canon-bras sur huit Robot Masters ennemis avant de mettre le cap sur Dr. Wily. L'écran de sélection de niveaux présente à nouveau chacun des adversaires : Gemini Man, Hard Man, Magnet Man, Needle Man, Shadow Man, Snake Man, Spark Man et Top Man. Lorsque Mega Man en vainc un, il s'empare de l'arme de son adversaire, comme le Spark Shock, le Gemini Laser, le Hard Knuckle, etc.
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